Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TP53BP1Q12888 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms