Protein–RNA interactions for Protein: Q12378

RTR2, RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RTR2, yeastyeast

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTR2Q12378 CMR3YPR013C 954 nt2.39□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YEF3YLR249W 3135 nt2.39□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 PSY2YNL201C 2577 nt2.39□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 ABD1YBR236C 1311 nt2.39□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 ORC1YML065W 2745 nt2.39□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 MET5YJR137C 4329 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 FRE8YLR047C 2061 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 MGA1YGR249W 1371 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 PSD2YGR170W 3417 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 GRX6YDL010W 696 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 RTK1YDL025C 1863 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 PRM9YAR031W 897 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 MST28YAR033W 705 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 MPD2YOL088C 834 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 RPS11BYBR048W 471 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YGR237CYGR237C 2358 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 CUS1YMR240C 1311 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 EXO84YBR102C 2262 nt2.38□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 ORC2YBR060C 1863 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 ARP8YOR141C 2646 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YKR070WYKR070W 1059 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 ENV10YLR065C 546 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 PEX12YMR026C 1200 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 SAS2YMR127C 1017 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YMR187CYMR187C 1296 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YPP1YGR198W 2454 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YPK1YKL126W 2043 nt2.37□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 SPP382YLR424W 2127 nt2.36□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YPK3YBR028C 1578 nt2.36□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 NAB3YPL190C 2409 nt2.36□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 ERP6YGL002W 651 nt2.36□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 ARC15YIL062C 465 nt2.36□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.36□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YLR462WYLR462W 609 nt2.36□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 SAM37YMR060C 984 nt2.36□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YBR089WYBR089W 600 nt2.36□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YGR160WYGR160W 612 nt2.35□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 BET3YKR068C 582 nt2.35□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 NRG2YBR066C 663 nt2.35□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 DAD3YBR233W-A 285 nt2.35□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 DNL4YOR005C 2835 nt2.34□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 WBP1YEL002C 1293 nt2.34□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 JIP3YLR331C 378 nt2.34□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 PSY3YLR376C 729 nt2.34□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YNR062CYNR062C 984 nt2.34□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 NDJ1YOL104C 1059 nt2.34□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 YPR136CYPR136C 513 nt2.34□□□□□ -2.03
RTR2Q12378 SVL3YPL032C 2478 nt2.34□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 SEC26YDR238C 2922 nt2.34□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 NEW1YPL226W 3591 nt2.34□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 CIK1YMR198W 1785 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 VPS64YDR200C 1815 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 CDC10YCR002C 969 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 snR70snR70 164 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 PEX14YGL153W 1026 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 DOG1YHR044C 741 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 FMC1YIL098C 468 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YLR124WYLR124W 345 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 VPS13YLL040C 9435 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 NFI1YOR156C 2181 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 NAB6YML117W 3405 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 SNX41YDR425W 1878 nt2.33□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 DSE4YNR067C 3354 nt2.32□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 GIN4YDR507C 3429 nt2.32□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 RPO41YFL036W 4056 nt2.32□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YDR249CYDR249C 1122 nt2.32□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 MTR2YKL186C 555 nt2.32□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 SED5YLR026C 1023 nt2.32□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YML037CYML037C 1023 nt2.32□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 FES1YBR101C 873 nt2.32□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 REG1YDR028C 3045 nt2.32□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 TRA1YHR099W 11235 nt2.32□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 TCB2YNL087W 3537 nt2.31□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 SOK1YDR006C 2706 nt2.31□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 MSH2YOL090W 2895 nt2.31□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 TIS11YLR136C 858 nt2.31□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 DCS1YLR270W 1053 nt2.31□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 PEX17YNL214W 600 nt2.31□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YPL276WYPL276W 438 nt2.31□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 YOL098CYOL098C 3114 nt2.31□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 TOF1YNL273W 3717 nt2.31□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 SPB4YFL002C 1821 nt2.31□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 KXD1YGL079W 657 nt2.3□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 BTS1YPL069C 1008 nt2.3□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 VMA9YCL005W-A 222 nt2.3□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 OAF3YKR064W 2592 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 HER2YMR293C 1395 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 RPL1BYGL135W 654 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 CLC1YGR167W 702 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.29□□□□□ -2.04
RTR2Q12378 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.29□□□□□ -2.04
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