Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 PHO5YBR093C 1404 nt4.37□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YBR238CYBR238C 2196 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 IZH1YDR492W 951 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 RSM28YDR494W 1086 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YGL109WYGL109W 324 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 PTI1YGR156W 1278 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 NIS1YNL078W 1224 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 IZH2YOL002C 954 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 HSH49YOR319W 642 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 USV1YPL230W 1176 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 HPA2YPR193C 471 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 MTH1YDR277C 1302 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 APL4YPR029C 2499 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 SST2YLR452C 2097 nt4.36□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 DSS1YMR287C 2910 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 ERP3YDL018C 678 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 RSM18YER050C 417 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 MST27YGL051W 705 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 SCM4YGR049W 564 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 MST28YAR033W 705 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 ARG80YMR042W 534 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 RPS11BYBR048W 471 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 TRS20YBR254C 528 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 RAD18YCR066W 1464 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 ORC4YPR162C 1590 nt4.35□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 HMLALPHA2YCL067C 633 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 MATALPHA2YCR039C 633 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 UBC13YDR092W 462 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YDR248CYDR248C 582 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YHR180WYHR180W 492 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 GPX1YKL026C 504 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 SSO2YMR183C 888 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 IDH2YOR136W 1110 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 snR17asnR17a 333 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 YCL002CYCL002C 792 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 TRM12YML005W 1389 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 PPQ1YPL179W 1650 nt4.34□□□□□ -1.71
CLF1Q12309 NOC2YOR206W 2133 nt4.33□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 FAS2YPL231W 5664 nt4.33□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 GPI10YGL142C 1851 nt4.33□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 AEP3YPL005W 1821 nt4.33□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YPK9YOR291W 4419 nt4.33□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 MED11YMR112C 396 nt4.33□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YOR263CYOR263C 408 nt4.33□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 ERB1YMR049C 2424 nt4.33□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 UBP12YJL197W 3765 nt4.33□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 DSN1YIR010W 1731 nt4.32□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 NAT1YDL040C 2565 nt4.32□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 UTP25YIL091C 2166 nt4.32□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 HMO1YDR174W 741 nt4.32□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 MAG1YER142C 891 nt4.32□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YGL138CYGL138C 1038 nt4.32□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 PRS3YHL011C 963 nt4.32□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 SGN1YIR001C 753 nt4.32□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 VMA1YDL185W 3216 nt4.32□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 ECM22YLR228C 2445 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YDL016CYDL016C 303 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YDL071CYDL071C 375 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 RPF1YHR088W 888 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YIL082WYIL082W 873 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 DPH1YIL103W 1278 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 BET4YJL031C 984 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 SFT1YKL006C-A 294 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 TRM112YNR046W 408 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 BRX1YOL077C 876 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 RIB4YOL143C 510 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 RCN2YOR220W 798 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 MEI5YPL121C 669 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YBR096WYBR096W 693 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 STP22YCL008C 1158 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 POF1YCL047C 777 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 VID28YIL017C 2766 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 DSE1YER124C 1722 nt4.31□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 ARP9YMR033W 1404 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 BCS1YDR375C 1371 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 BIK1YCL029C 1323 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 NCR1YPL006W 3513 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 PRP11YDL043C 801 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 MTC7YEL033W 420 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YGR026WYGR026W 837 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 BIO2YGR286C 1128 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 GEP4YHR100C 558 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 IME1YJR094C 1083 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 IES3YLR052W 753 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 SEC14YMR079W 915 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 ASC1YMR116C 960 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 FSH3YOR280C 801 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 NHX1YDR456W 1902 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 SDS23YGL056C 1584 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 CEX1YOR112W 2286 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 NOG1YPL093W 1944 nt4.3□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 AEP2YMR282C 1743 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 EPO1YMR124W 2832 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 YCR001WYCR001W 315 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 TSC13YDL015C 933 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 BSC2YDR275W 708 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 APA2YDR530C 978 nt4.29□□□□□ -1.72
CLF1Q12309 MND1YGL183C 660 nt4.29□□□□□ -1.72
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