Protein–RNA interactions for Protein: Q12093

SLM3, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLM3Q12093 YML053CYML053C 639 nt3.33□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 MCM16YPR046W 546 nt3.33□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 HPA2YPR193C 471 nt3.33□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YBR141W-AYBR141W-A 96 nt3.33□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt3.33□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YGL188CYGL188C 174 nt3.32□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 OKP1YGR179C 1221 nt3.32□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YHI9YHR029C 885 nt3.32□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YAL037WYAL037W 804 nt3.32□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 FOL3YMR113W 1284 nt3.32□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 MRPS17YMR188C 714 nt3.32□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 CYC2YOR037W 1101 nt3.32□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 SUT2YPR009W 807 nt3.32□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YPR142CYPR142C 564 nt3.32□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 PST1YDR055W 1335 nt3.32□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 KAR5YMR065W 1515 nt3.31□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 ATG21YPL100W 1491 nt3.31□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 RPC11YDR045C 333 nt3.31□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 DET1YDR051C 1005 nt3.31□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 MTR2YKL186C 555 nt3.31□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YLR311CYLR311C 348 nt3.31□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 SEC65YML105C 822 nt3.31□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 ICY1YMR195W 384 nt3.31□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 TMC1YOR052C 453 nt3.31□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 TRK1YJL129C 3708 nt3.31□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 BCK1YJL095W 4437 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 ERG11YHR007C 1593 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 PRP3YDR473C 1410 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 RRI1YDL216C 1323 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 RRG1YDR065W 1098 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 CAJ1YER048C 1176 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YPT35YHR105W 645 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 IST1YNL265C 897 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YOR114WYOR114W 885 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 HSH49YOR319W 642 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 FRM2YCL026C-A 582 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 UBP12YJL197W 3765 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 KRI1YNL308C 1776 nt3.3□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 OAF3YKR064W 2592 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 TPD3YAL016W 1908 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 SEC26YDR238C 2922 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 AEP3YPL005W 1821 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 PSY1YKL076C 384 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 POP8YBL018C 402 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 MED11YMR112C 396 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 RUF21RUF21 707 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 RPL20BYOR312C 519 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 RPS11BYBR048W 471 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 KAR4YCL055W 1008 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 SRC1YML034W 2505 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 SGS1YMR190C 4344 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 NAB3YPL190C 2409 nt3.29□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 SER3YER081W 1410 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 PDR1YGL013C 3207 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 CAF120YNL278W 3183 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 PEX1YKL197C 3132 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YFL065CYFL065C 309 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 PCL7YIL050W 858 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 RPL13BYMR142C 600 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 YMR187CYMR187C 1296 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 RIB5YBR256C 717 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 KRE5YOR336W 4098 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 PGS1YCL004W 1566 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 ULP1YPL020C 1866 nt3.28□□□□□ -1.88
SLM3Q12093 DSN1YIR010W 1731 nt3.27□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 TRM12YML005W 1389 nt3.27□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 BSC2YDR275W 708 nt3.27□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 YGR026WYGR026W 837 nt3.27□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 USV1YPL230W 1176 nt3.27□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 HAA1YPR008W 2085 nt3.27□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 KIP3YGL216W 2418 nt3.27□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 SEG1YMR086W 2883 nt3.26□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 GRS2YPR081C 1857 nt3.26□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 EAF7YNL136W 1278 nt3.26□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 YOR050CYOR050C 348 nt3.26□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 SSP2YOR242C 1116 nt3.26□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 RRD2YPL152W 1077 nt3.26□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 FLO9YAL063C 3969 nt3.26□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 STT4YLR305C 5703 nt3.26□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 SCP160YJL080C 3669 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 APN2YBL019W 1563 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 COX2Q0250 756 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 SIC1YLR079W 855 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 RPN8YOR261C 1017 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 LDH1YBR204C 1128 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 IOC2YLR095C 2439 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 CAF130YGR134W 3369 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 MCD4YKL165C 2760 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 SPT16YGL207W 3108 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 AXL1YPR122W 3627 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 YOR365CYOR365C 2112 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 NUF2YOL069W 1356 nt3.25□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 RPO41YFL036W 4056 nt3.24□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 RRP14YKL082C 1305 nt3.24□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 GIN4YDR507C 3429 nt3.24□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 YDR061WYDR061W 1620 nt3.24□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt3.24□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt3.24□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 AYR1YIL124W 894 nt3.24□□□□□ -1.89
SLM3Q12093 SSO2YMR183C 888 nt3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms