Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KCNA1Q09470 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KCNA1Q09470 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms