Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLFN5Q08AF3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLFN5Q08AF3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLFN5Q08AF3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms