Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACTN3Q08043 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACTN3Q08043 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms