Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EXOSC9Q06265 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EXOSC9Q06265 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms