Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YFL065C	YFL065C	309 nt		3.72	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	RPS25A	YGR027C	327 nt		3.72	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	YBR053C	YBR053C	1077 nt		3.72	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	VPS30	YPL120W	1674 nt		3.71	□□□□□ -1.81
MRD1	Q06106	PDS1	YDR113C	1122 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YFL051C	YFL051C	483 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	CDC26	YFR036W	375 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YGR190C	YGR190C	366 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	CUP1-1	YHR053C	186 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	CUP1-2	YHR055C	186 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	CFD1	YIL003W	882 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	PSF2	YJL072C	642 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YJR037W	YJR037W	384 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	GLO1	YML004C	981 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YOR082C	YOR082C	342 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	snR44	snR44	211 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	APA1	YCL050C	966 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	PEX34	YCL056C	435 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	STU2	YLR045C	2667 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	SLM2	YNL047C	1971 nt		3.71	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	ARG5,6	YER069W	2592 nt		3.7	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YDR535C	YDR535C	501 nt		3.7	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	TDA10	YGR205W	873 nt		3.7	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	APC9	YLR102C	798 nt		3.7	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	GPN3	YLR243W	819 nt		3.7	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	UBC12	YLR306W	567 nt		3.7	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	SAM37	YMR060C	984 nt		3.7	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	PRM4	YPL156C	855 nt		3.7	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	NOP4	YPL043W	2058 nt		3.7	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	PHO5	YBR093C	1404 nt		3.7	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	BAR1	YIL015W	1764 nt		3.69	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	GCD14	YJL125C	1152 nt		3.69	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	MET14	YKL001C	609 nt		3.69	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YLR290C	YLR290C	834 nt		3.69	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YLR365W	YLR365W	333 nt		3.69	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	MRPL16	YBL038W	699 nt		3.69	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	RPS10A	YOR293W	318 nt		3.69	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YPR136C	YPR136C	513 nt		3.69	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	MON1	YGL124C	1935 nt		3.69	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YDR131C	YDR131C	1671 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	BI3	Q0115	1554 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	SLS1	YLR139C	1932 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	QRI7	YDL104C	1224 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YDR340W	YDR340W	303 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	TLG1	YDR468C	675 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	PEX14	YGL153W	1026 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	TAN1	YGL232W	870 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YIR014W	YIR014W	729 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YJL175W	YJL175W	513 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YBL062W	YBL062W	381 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YNL319W	YNL319W	441 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	DIB1	YPR082C	432 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	TIM12	YBR091C	330 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	ERV15	YBR210W	429 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	PFK26	YIL107C	2484 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	NEM1	YHR004C	1341 nt		3.68	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	ECO1	YFR027W	846 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YGR111W	YGR111W	1203 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YIL024C	YIL024C	570 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YVH1	YIR026C	1095 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	POL32	YJR043C	1053 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YAL034C-B	YAL034C-B	354 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	ERG2	YMR202W	669 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	FMP41	YNL168C	780 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YAK1	YJL141C	2424 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	RDS2	YPL133C	1341 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	DNM1	YLL001W	2274 nt		3.67	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	STT4	YLR305C	5703 nt		3.66	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YDL199C	YDL199C	2064 nt		3.66	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	SIN4	YNL236W	2925 nt		3.66	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	GCN1	YGL195W	8019 nt		3.66	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	UBC9	YDL064W	474 nt		3.66	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YDL157C	YDL157C	357 nt		3.66	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	MGT1	YDL200C	567 nt		3.66	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	PMI40	YER003C	1290 nt		3.66	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	YAL064W	YAL064W	285 nt		3.66	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	CIN8	YEL061C	3003 nt		3.66	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	DSE1	YER124C	1722 nt		3.65	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	ART10	YLR392C	1557 nt		3.65	□□□□□ -1.82
MRD1	Q06106	GPP2	YER062C	753 nt		3.65	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	PTI1	YGR156W	1278 nt		3.65	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	EPT1	YHR123W	1176 nt		3.65	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	YLR169W	YLR169W	354 nt		3.65	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	RAD33	YML011C	534 nt		3.65	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	TRI1	YMR233W	681 nt		3.65	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	YMR316C-A	YMR316C-A	312 nt		3.65	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	YNL226W	YNL226W	411 nt		3.65	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	HUB1	YNR032C-A	222 nt		3.65	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	PIN3	YPR154W	648 nt		3.65	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	BMS1	YPL217C	3552 nt		3.64	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	YMR317W	YMR317W	3423 nt		3.64	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	RPS29B	YDL061C	171 nt		3.64	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	NKP1	YDR383C	717 nt		3.64	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	LRS4	YDR439W	1044 nt		3.64	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	TAM41	YGR046W	1158 nt		3.64	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	CMC1	YKL137W	336 nt		3.64	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	SMD3	YLR147C	306 nt		3.64	□□□□□ -1.83
MRD1	Q06106	RDN58-1	RDN58-1	158 nt		3.64	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.1 ms