Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DEUP1Q05D60 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DEUP1Q05D60 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms