Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 YKT6YKL196C 603 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YKR033CYKR033C 426 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 PBA1YLR199C 831 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 RPL13BYMR142C 600 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YPL276WYPL276W 438 nt3.31□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 VPS64YDR200C 1815 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 SLP1YOR154W 1764 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 PFK26YIL107C 2484 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YAK1YJL141C 2424 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YDL241WYDL241W 372 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 PEX10YDR265W 1014 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 KXD1YGL079W 657 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 TAM41YGR046W 1158 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 CIR1YGR207C 786 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YOL024WYOL024W 519 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 FAS1YKL182W 6156 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 TRE2YOR256C 2430 nt3.3□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 TCB2YNL087W 3537 nt3.29□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 PST1YDR055W 1335 nt3.29□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 RIM1YCR028C-A 408 nt3.29□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YDL242WYDL242W 354 nt3.29□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 RRP8YDR083W 1179 nt3.29□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YDR355CYDR355C 303 nt3.29□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.29□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 RAS1YOR101W 930 nt3.29□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 ACA1YER045C 1470 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 HBT1YDL223C 3141 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 DBP5YOR046C 1449 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 BCS1YDR375C 1371 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 ABD1YBR236C 1311 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YGR204C-AYGR204C-A 114 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YIL025CYIL025C 375 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 GPI14YJR013W 1212 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 MRPS17YMR188C 714 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 HUB1YNR032C-A 222 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 YOR082CYOR082C 342 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 FAR1YJL157C 2493 nt3.28□□□□□ -1.88
CSI1Q04368 IKI3YLR384C 4050 nt3.28□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 AXL1YPR122W 3627 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 APN2YBL019W 1563 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 TGL2YDR058C 981 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YDR340WYDR340W 303 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 SPT2YER161C 1002 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 IRC6YFR043C 714 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YIP5YGL161C 933 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 AML1YGR001C 747 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 RPS23AYGR118W 438 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YLR416CYLR416C 399 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 MED11YMR112C 396 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 RPS7AYOR096W 573 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 MCA1YOR197W 1299 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 RPS23BYPR132W 438 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YBR089WYBR089W 600 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YSA1YBR111C 696 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YKR015CYKR015C 1707 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YHR078WYHR078W 1659 nt3.27□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 STT4YLR305C 5703 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 NSE3YDR288W 912 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 PRE1YER012W 597 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YHR214C-DYHR214C-D 294 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 RNR2YJL026W 1200 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 TDA8YAL064C-A 381 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YAR069CYAR069C 294 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 OST6YML019W 999 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 RAD10YML095C 633 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YBL094CYBL094C 333 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 CAF20YOR276W 486 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 MSM1YGR171C 1728 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YLR278CYLR278C 4026 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 MEK1YOR351C 1494 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 CHS3YBR023C 3498 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 SSE2YBR169C 2082 nt3.26□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 TRM12YML005W 1389 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 RPL1BYGL135W 654 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 TRI1YMR233W 681 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YMR310CYMR310C 954 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YOR263CYOR263C 408 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 RPL1AYPL220W 654 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YGR237CYGR237C 2358 nt3.25□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 FRE4YNR060W 2160 nt3.24□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 STP2YHR006W 1626 nt3.24□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YJR020WYJR020W 333 nt3.24□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 HHF1YBR009C 312 nt3.24□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 GPI2YPL076W 843 nt3.24□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 MIP6YHR015W 1980 nt3.23□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YJL132WYJL132W 2253 nt3.23□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YHL045WYHL045W 348 nt3.23□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 IME1YJR094C 1083 nt3.23□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 YNL234WYNL234W 1281 nt3.23□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 PPT2YPL148C 522 nt3.23□□□□□ -1.89
CSI1Q04368 NMA111YNL123W 2994 nt3.23□□□□□ -1.89
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