Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPL6Q02878 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPL6Q02878 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms