Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNTN2Q02246 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNTN2Q02246 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms