Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC6A3Q01959 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC6A3Q01959 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms