Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDR2Q01850 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms