Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
XPCQ01831 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
XPCQ01831 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XPCQ01831 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XPCQ01831 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XPCQ01831 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XPCQ01831 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XPCQ01831 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
XPCQ01831 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XPCQ01831 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
XPCQ01831 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
XPCQ01831 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPCQ01831 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPCQ01831 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPCQ01831 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPCQ01831 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPCQ01831 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPCQ01831 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPCQ01831 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPCQ01831 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPCQ01831 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
XPCQ01831 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
XPCQ01831 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XPCQ01831 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XPCQ01831 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XPCQ01831 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
XPCQ01831 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
XPCQ01831 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
XPCQ01831 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
XPCQ01831 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XPCQ01831 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
XPCQ01831 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
XPCQ01831 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
XPCQ01831 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
XPCQ01831 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
XPCQ01831 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XPCQ01831 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XPCQ01831 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
XPCQ01831 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XPCQ01831 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
XPCQ01831 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XPCQ01831 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XPCQ01831 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XPCQ01831 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XPCQ01831 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XPCQ01831 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XPCQ01831 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
XPCQ01831 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
XPCQ01831 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPCQ01831 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPCQ01831 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPCQ01831 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPCQ01831 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPCQ01831 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPCQ01831 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPCQ01831 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPCQ01831 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPCQ01831 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
XPCQ01831 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XPCQ01831 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
XPCQ01831 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XPCQ01831 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XPCQ01831 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
XPCQ01831 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
XPCQ01831 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
XPCQ01831 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
XPCQ01831 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms