Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SATB1Q01826 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SATB1Q01826 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms