Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Apoa1Q00623 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Apoa1Q00623 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms