Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NDPQ00604 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NDPQ00604 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NDPQ00604 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NDPQ00604 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NDPQ00604 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDPQ00604 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NDPQ00604 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms