Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMAD3P84022 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMAD3P84022 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms