Protein–RNA interactions for Protein: P69891

HBG1, Hemoglobin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBG1P69891 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HBG1P69891 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HBG1P69891 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HBG1P69891 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HBG1P69891 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBG1P69891 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBG1P69891 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HBG1P69891 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBG1P69891 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBG1P69891 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBG1P69891 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBG1P69891 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBG1P69891 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBG1P69891 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBG1P69891 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBG1P69891 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HBG1P69891 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HBG1P69891 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBG1P69891 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBG1P69891 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBG1P69891 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBG1P69891 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBG1P69891 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBG1P69891 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBG1P69891 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HBG1P69891 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HBG1P69891 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms