Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSNK2A1P68400 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CSNK2A1P68400 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms