Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTG1P63261 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ACTG1P63261 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.9 ms