Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL7AP62424 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL7AP62424 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms