Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TMEM258P61165 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms