Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00315P59091 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms