Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSX2P58304 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VSX2P58304 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VSX2P58304 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VSX2P58304 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VSX2P58304 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
VSX2P58304 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
VSX2P58304 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VSX2P58304 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
VSX2P58304 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VSX2P58304 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VSX2P58304 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VSX2P58304 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VSX2P58304 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX2P58304 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX2P58304 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX2P58304 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX2P58304 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX2P58304 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX2P58304 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX2P58304 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX2P58304 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VSX2P58304 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX2P58304 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VSX2P58304 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms