Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNX16P57768 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SNX16P57768 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SNX16P57768 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SNX16P57768 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SNX16P57768 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX16P57768 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX16P57768 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SNX16P57768 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms