Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TPTEP56180 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TPTEP56180 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TPTEP56180 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TPTEP56180 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TPTEP56180 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TPTEP56180 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms