Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SH3BGRP55822 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SH3BGRP55822 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms