Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELLP55199 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELLP55199 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ELLP55199 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ELLP55199 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ELLP55199 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ELLP55199 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ELLP55199 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms