Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAD23AP54725 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
RAD23AP54725 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms