Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YLR157C-C	YLR157C-C	132 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YLR159C-A	YLR159C-A	132 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YLR290C	YLR290C	834 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RPL13B	YMR142C	600 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YBR137W	YBR137W	540 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	ARO1	YDR127W	4767 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RCY1	YJL204C	2523 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YEL025C	YEL025C	3567 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RAD5	YLR032W	3510 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	NEM1	YHR004C	1341 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	TLG1	YDR468C	675 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	WBP1	YEL002C	1293 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YFR057W	YFR057W	456 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YGR283C	YGR283C	1026 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YKE4	YIL023C	1041 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YIL024C	YIL024C	570 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	ENT3	YJR125C	1227 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RPL17A	YKL180W	555 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	SRT1	YMR101C	1032 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YBL065W	YBL065W	345 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	END3	YNL084C	1050 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	GIS2	YNL255C	462 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	BCH1	YMR237W	2175 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	LCB4	YOR171C	1875 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	ARP9	YMR033W	1404 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	CSR2	YPR030W	3366 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	DAP2	YHR028C	2457 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	MTL1	YGR023W	1656 nt		3.43	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	BI3	Q0115	1554 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	TFC1	YBR123C	1950 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	FAR1	YJL157C	2493 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	UBC9	YDL064W	474 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	CBS2	YDR197W	1170 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RRP17	YDR412W	708 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	tL(UAG)J	tL(UAG)J	82 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	tL(UAG)L1	tL(UAG)L1	82 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	tL(UAG)L2	tL(UAG)L2	82 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	TMA19	YKL056C	504 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	ERP1	YAR002C-A	660 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	MOH1	YBL049W	417 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YOL106W	YOL106W	354 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	FIG1	YBR040W	897 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	PHO88	YBR106W	567 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	MIT1	YEL007W	2001 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	SPT10	YJL127C	1923 nt		3.42	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	CDH1	YGL003C	1701 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	TIF4631	YGR162W	2859 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	BUD4	YJR092W	4344 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YDR271C	YDR271C	372 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	GPP2	YER062C	753 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	AML1	YGR001C	747 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	VMA7	YGR020C	357 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	MPC3	YGR243W	441 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YLR347W-A	YLR347W-A	141 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YBL010C	YBL010C	843 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	IPP1	YBR011C	864 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	SPN1	YPR133C	1233 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	CTP1	YBR291C	900 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RPN6	YDL097C	1305 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	SLA1	YBL007C	3735 nt		3.41	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YAT2	YER024W	2772 nt		3.4	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YDR340W	YDR340W	303 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RPN9	YDR427W	1182 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YEL010W	YEL010W	351 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	PMI40	YER003C	1290 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	CFD1	YIL003W	882 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	MMF1	YIL051C	438 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YIL161W	YIL161W	708 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	GLG2	YJL137C	1143 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	ECM13	YBL043W	774 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YNL013C	YNL013C	378 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	TIR2	YOR010C	756 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	FLO1	YAR050W	4614 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	CHA4	YLR098C	1947 nt		3.4	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	EMP70	YLR083C	2004 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	UBP5	YER144C	2418 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	TAO3	YIL129C	7131 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RPS29B	YDL061C	171 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YDR442W	YDR442W	393 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YKL131W	YKL131W	522 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RDN58-1	RDN58-1	158 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RDN58-2	RDN58-2	158 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YMR158C-A	YMR158C-A	138 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	ASI2	YNL159C	870 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YPR136C	YPR136C	513 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	PRM15	YMR278W	1869 nt		3.39	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	STE24	YJR117W	1362 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	ISM1	YPL040C	3009 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	PHO5	YBR093C	1404 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	RPA14	YDR156W	414 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YGL082W	YGL082W	1146 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YGL230C	YGL230C	444 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	BCD1	YHR040W	1101 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	MRPL49	YJL096W	486 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	YAL016C-B	YAL016C-B	186 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	COX19	YLL018C-A	297 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	FLD1	YLR404W	858 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	TEM1	YML064C	738 nt		3.38	□□□□□ -1.87
DSL1	P53847	HUB1	YNR032C-A	222 nt		3.38	□□□□□ -1.87

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