Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ITGA8P53708 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ITGA8P53708 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms