Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOSBP53539 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOSBP53539 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOSBP53539 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOSBP53539 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOSBP53539 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOSBP53539 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOSBP53539 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOSBP53539 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOSBP53539 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOSBP53539 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOSBP53539 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOSBP53539 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOSBP53539 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOSBP53539 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOSBP53539 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOSBP53539 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOSBP53539 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOSBP53539 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOSBP53539 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOSBP53539 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOSBP53539 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOSBP53539 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOSBP53539 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOSBP53539 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOSBP53539 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOSBP53539 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOSBP53539 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOSBP53539 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOSBP53539 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOSBP53539 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOSBP53539 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms