Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2E1P51965 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms