Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
SMARCA2P51531 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
SMARCA2P51531 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
SMARCA2P51531 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms