Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV1P50549 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV1P50549 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV1P50549 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV1P50549 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV1P50549 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ETV1P50549 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETV1P50549 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETV1P50549 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETV1P50549 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETV1P50549 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETV1P50549 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETV1P50549 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ETV1P50549 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms