Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MRE11P49959 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRE11P49959 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRE11P49959 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRE11P49959 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRE11P49959 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRE11P49959 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRE11P49959 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRE11P49959 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRE11P49959 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRE11P49959 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRE11P49959 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRE11P49959 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRE11P49959 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRE11P49959 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRE11P49959 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRE11P49959 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRE11P49959 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRE11P49959 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRE11P49959 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRE11P49959 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRE11P49959 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRE11P49959 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRE11P49959 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRE11P49959 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRE11P49959 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRE11P49959 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRE11P49959 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRE11P49959 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRE11P49959 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRE11P49959 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRE11P49959 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRE11P49959 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRE11P49959 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRE11P49959 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRE11P49959 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRE11P49959 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRE11P49959 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRE11P49959 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRE11P49959 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms