Protein–RNA interactions for Protein: P49763

PGF, Placenta growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGFP49763 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGFP49763 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGFP49763 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGFP49763 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGFP49763 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGFP49763 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGFP49763 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGFP49763 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGFP49763 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGFP49763 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGFP49763 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PGFP49763 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGFP49763 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGFP49763 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms