Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK8P49336 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK8P49336 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK8P49336 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK8P49336 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK8P49336 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK8P49336 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK8P49336 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK8P49336 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK8P49336 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK8P49336 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK8P49336 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK8P49336 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK8P49336 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK8P49336 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK8P49336 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK8P49336 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK8P49336 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK8P49336 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms