Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMAN1P49257 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMAN1P49257 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms