Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRPC1P48995 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRPC1P48995 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms