Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PIP4K2AP48426 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PIP4K2AP48426 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms