Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GNPDA1P46926 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GNPDA1P46926 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms