Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MAGEA1P43355 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAGEA1P43355 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms