Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 TFC1YBR123C 1950 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 CLN2YPL256C 1638 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 RMD5YDR255C 1266 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YGL118CYGL118C 438 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 RPS21BYJL136C 264 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 SPO20YMR017W 1194 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 SSU72YNL222W 621 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 TEX1YNL253W 1269 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 TEC1YBR083W 1461 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 PMR1YGL167C 2853 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 CMK1YFR014C 1341 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 RDS2YPL133C 1341 nt2.87□□□□□ -1.95
DDI1P40087 EMP70YLR083C 2004 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 FUN30YAL019W 3396 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 PHO81YGR233C 3537 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 NHP10YDL002C 612 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 TAN1YGL232W 870 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 PAN5YHR063C 1140 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 MRPL6YHR147C 645 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 DCG1YIR030C 735 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 GCD14YJL125C 1152 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 COQ9YLR201C 783 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YLR290CYLR290C 834 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 GLO1YML004C 981 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 MRP2YPR166C 348 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 MRPL27YBR282W 441 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 ESL1YIL151C 3357 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 ITT1YML068W 1395 nt2.86□□□□□ -1.95
DDI1P40087 SHQ1YIL104C 1524 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YDL026WYDL026W 312 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 LRS4YDR439W 1044 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 PTI1YGR156W 1278 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 DAL2YIR029W 1032 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YLR230WYLR230W 306 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 SSN8YNL025C 972 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 AAH1YNL141W 1044 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 ATG13YPR185W 2217 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 CDC40YDR364C 1368 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 RSM23YGL129C 1353 nt2.85□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YML096WYML096W 1578 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 RRP42YDL111C 798 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 ISC10YER180C 804 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 CPR7YJR032W 1182 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 RNH203YLR154C 333 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YNL035CYNL035C 1170 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 TRM112YNR046W 408 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 RPS10AYOR293W 318 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YPR142CYPR142C 564 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 BPT1YLL015W 4680 nt2.84□□□□□ -1.95
DDI1P40087 ITC1YGL133W 3795 nt2.84□□□□□ -1.96
DDI1P40087 GCD6YDR211W 2139 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 RDI1YDL135C 609 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 RPL35BYDL136W 363 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YDL186WYDL186W 834 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 THO1YER063W 657 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YGR190CYGR190C 366 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 TFA2YKR062W 987 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 USB1YLR132C 873 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 RSM19YNR037C 276 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YPL107WYPL107W 747 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 NIP7YPL211W 546 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 DIM1YPL266W 957 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YAT2YER024W 2772 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 KIN82YCR091W 2163 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 RPN4YDL020C 1596 nt2.83□□□□□ -1.96
DDI1P40087 MSH2YOL090W 2895 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 RAX2YLR084C 3663 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 DYN1YKR054C 12279 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 TSC13YDL015C 933 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YGR064WYGR064W 369 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 SOL3YHR163W 750 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 PCL7YIL050W 858 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 AIM26YKL037W 357 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 VMA5YKL080W 1179 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 snR11snR11 258 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 TFC4YGR047C 3078 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 ECM18YDR125C 1362 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 FLO11YIR019C 4104 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 MYO5YMR109W 3660 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 REG1YDR028C 3045 nt2.82□□□□□ -1.96
DDI1P40087 FRE2YKL220C 2136 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YJR061WYJR061W 2808 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 AIM11YER093C-A 414 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 KEG1YFR042W 603 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 PNC1YGL037C 651 nt2.81□□□□□ -1.96
DDI1P40087 YHR097CYHR097C 1101 nt2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21 ms