Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6P35125 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6P35125 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6P35125 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6P35125 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6P35125 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6P35125 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6P35125 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6P35125 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USP6P35125 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
USP6P35125 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP6P35125 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP6P35125 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USP6P35125 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USP6P35125 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USP6P35125 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USP6P35125 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP6P35125 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP6P35125 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP6P35125 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP6P35125 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP6P35125 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP6P35125 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
USP6P35125 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USP6P35125 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6P35125 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6P35125 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6P35125 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6P35125 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6P35125 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6P35125 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6P35125 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP6P35125 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP6P35125 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP6P35125 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP6P35125 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
USP6P35125 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
USP6P35125 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP6P35125 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP6P35125 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP6P35125 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP6P35125 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP6P35125 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP6P35125 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP6P35125 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP6P35125 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP6P35125 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms