Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC1P35052 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC1P35052 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC1P35052 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC1P35052 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms