Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPP30301 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPP30301 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPP30301 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPP30301 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPP30301 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPP30301 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPP30301 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPP30301 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MIPP30301 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MIPP30301 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPP30301 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPP30301 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPP30301 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPP30301 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPP30301 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPP30301 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPP30301 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPP30301 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPP30301 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MIPP30301 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPP30301 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPP30301 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPP30301 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPP30301 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPP30301 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPP30301 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPP30301 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPP30301 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MIPP30301 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIPP30301 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIPP30301 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIPP30301 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MIPP30301 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPP30301 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPP30301 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPP30301 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPP30301 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPP30301 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPP30301 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPP30301 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPP30301 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPP30301 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MIPP30301 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MIPP30301 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MIPP30301 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MIPP30301 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms